Протеомные "часы органов"

Эрик Топол в своих статьях на Substack Ground Truths и книге Super Agers уделяет значительное внимание протеомным "часам органов", подчеркивая их потенциал для понимания старения и прогнозирования заболеваний. Эти "часы" представляют собой значительный прорыв в области высокопроизводительной протеомики и искусственного интеллекта (ИИ), позволяющий измерять и анализировать тысячи белков в плазме крови, чтобы получить представление о здоровье и траектории заболевания человека.
Вот более подробная информация о протеомных "часах органов":
-
Суть и открытие
- Концепция протеомных "часов органов" основывается на способности измерять тысячи белков в образце крови и использовать модели машинного обучения для выявления кластеров белков, связанных с возрастом конкретных органов.
- Тони Висс-Корей из Стэнфордского университета и его международная команда считаются пионерами в этой области, опубликовав знаковую работу по этой теме на обложке журнала Nature.
- Исследования, проводившиеся на больших когортах, таких как Британский биобанк, измеряли тысячи плазменных белков (например, 11 000 белков с помощью платформы SomaLogic или более 5 400 белков с помощью Olink) для создания этих "часов".
-
Расчет и выводы
- Для расчета "разрыва в возрасте органа" (organ age gap) сравнивается биологический возраст органа с хронологическим возрастом человека.
- Было идентифицировано 11 органов, для которых можно было определить "возраст" на основе плазменных белков: жировая ткань, артерии, мозг, сердце, иммунная ткань, кишечник, почки, печень, легкие, мышцы и поджелудочная железа.
- Около 20% людей были "экстремальными стареющими" (hyper-agers) хотя бы по одному органу, что означает, что физиологически их орган был значительно старше их хронологического возраста. Только 2% имели ускоренное старение нескольких органов.
-
Клиническое значение и прогностическая ценность
- Прогнозирование заболеваний: Ускоренное старение органа было связано с повышенным риском развития конкретных заболеваний. Например, ускоренное старение сердца в 2,5 раза увеличивало риск развития сердечной недостаточности, старение мозга – риск болезни Альцгеймера, а старение мышц – нарушение походки. Старение почек предсказывало метаболический синдром и высокое кровяное давление.
- Смертность: Разрыв между хронологическим возрастом человека и возрастом органа был связан с увеличением риска смертности в течение 15 лет наблюдения.
- Влияние образа жизни: Протеомные "часы органов" показали чувствительность к различным вмешательствам и факторам образа жизни:
- Курение было связано с ускоренным темпом старения всех изученных органов.
- Употребление алкоголя ускоряло старение кишечника.
- Физические упражнения (умеренные и энергичные) и диета (например, употребление жирной рыбы, птицы, свежих фруктов, приготовленных и сырых овощей) ассоциировались с замедлением старения органов, в то время как обработанное мясо, сладости, газированные напитки и жареный картофель — с неблагоприятным воздействием.
- Гормональная терапия (эстроген) у женщин после менопаузы была связана с замедлением старения большинства органов.
- Ранняя диагностика и профилактика: Эти "часы" могут помочь выявить людей с высоким риском развития органоспецифических заболеваний на ранних стадиях, что открывает возможности для раннего вмешательства и профилактики. Например, медленное старение мозга или иммунной системы было связано с улучшением выживаемости.
-
Отличие от других методов
- В отличие от общебиологических часов старения (таких как по эпигенетическим модификациям ДНК, например, GrimAge), протеомные "часы органов" дают представление о старении конкретных органов внутри одного человека.
- Они могут дополнять или даже превосходить полигенные факторы риска по точности прогнозирования некоторых заболеваний.
-
Будущее и ограничения
- Цель состоит в том, чтобы замедлить биологический процесс старения в конкретном органе у людей с "экстремальным старением".
- Эти исследования также выявляют конкретные белки, которые могут служить мишенями для разработки новых лекарств.
- Хотя высокопроизводительная протеомика является дорогостоящей (500–1000 долларов за человека), валидированные панели белков для конкретной оценки риска могут значительно снизить затраты.
- Важно помнить, что эти данные в основном показывают ассоциации, а не причинно-следственные связи. Однако использование таких методов, как менделевская рандомизация, помогает установить причинные выводы для некоторых белков.
В целом, протеомные "часы органов" представляют собой замечательную серию отчетов, обладающих значительным потенциалом для переосмысления оценки здоровья и заболеваний в будущем, добавляя значимости возможностям медицинского прогнозирования на индивидуальном уровне.